Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SSX1Q16384 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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SSX1Q16384 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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SSX1Q16384 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
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SSX1Q16384 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SSX1Q16384 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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