Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CCDC6Q16204 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CCDC6Q16204 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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