Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SCN9AQ15858 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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