Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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SEC23AQ15436 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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SEC23AQ15436 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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SEC23AQ15436 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23AQ15436 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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