Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UBE3CQ15386 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms