Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRD3Q15059 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms