Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SPIDRQ14159 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.9 ms