Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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CKAP5Q14008 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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CKAP5Q14008 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CKAP5Q14008 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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