Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SHROOM2Q13796 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SHROOM2Q13796 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SHROOM2Q13796 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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SHROOM2Q13796 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SHROOM2Q13796 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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