Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
APOFQ13790 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
APOFQ13790 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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APOFQ13790 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
APOFQ13790 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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