Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CACNA1SQ13698 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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