Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
IRF5Q13568 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
IRF5Q13568 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms