Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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