Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
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TCOF1Q13428 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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TCOF1Q13428 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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TCOF1Q13428 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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TCOF1Q13428 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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TCOF1Q13428 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
TCOF1Q13428 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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