Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SP140Q13342 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SP140Q13342 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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