Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIN2BQ13224 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
GRIN2BQ13224 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms