Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PPFIA1Q13136 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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