Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CSTF3Q12996 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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