Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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NUP160Q12769 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NUP160Q12769 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
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