Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
CHRNEQ04844 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.78□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CHRNEQ04844 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.2 ms