Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PGGT1BP53609 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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PGGT1BP53609 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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