Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTPS1P17812 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CTPS1P17812 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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