Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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IRGMA1A4Y4 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IRGMA1A4Y4 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
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IRGMA1A4Y4 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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IRGMA1A4Y4 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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IRGMA1A4Y4 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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IRGMA1A4Y4 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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IRGMA1A4Y4 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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IRGMA1A4Y4 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
IRGMA1A4Y4 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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