Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX13Q9Y5W8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX13Q9Y5W8 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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SNX13Q9Y5W8 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
SNX13Q9Y5W8 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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