Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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