Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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HCN3Q9P1Z3 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HCN3Q9P1Z3 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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