Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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MEIS3Q99687 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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MEIS3Q99687 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
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MEIS3Q99687 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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MEIS3Q99687 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
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MEIS3Q99687 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
MEIS3Q99687 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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