Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SMG1Q96Q15 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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