Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FAM3DQ96BQ1 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms