Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
C9orf135Q5VTT2 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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