Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.25
IMPG1Q17R60 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IMPG1Q17R60 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms