Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CDO1Q16878 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms