Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ZNF239Q16600 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms