Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RPE65Q16518 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RPE65Q16518 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RPE65Q16518 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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RPE65Q16518 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RPE65Q16518 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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