Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
CCDC6Q16204 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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