Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
USF2Q15853 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
USF2Q15853 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
USF2Q15853 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
USF2Q15853 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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