Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHHQ15465 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SHHQ15465 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SHHQ15465 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SHHQ15465 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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