Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRRQ15256 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRRQ15256 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRRQ15256 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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