Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
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SHPRHQ149N8 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SHPRHQ149N8 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SHPRHQ149N8 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
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