Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SCN5AQ14524 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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