Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
NEDD9Q14511 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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