Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
COL9A3Q14050 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL9A3Q14050 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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