Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CDH18Q13634 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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CDH18Q13634 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CDH18Q13634 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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CDH18Q13634 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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CDH18Q13634 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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