Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SQSTM1Q13501 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SQSTM1Q13501 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SQSTM1Q13501 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SQSTM1Q13501 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SQSTM1Q13501 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SQSTM1Q13501 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SQSTM1Q13501 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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