Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
TCIRG1Q13488 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms