Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
TOP3AQ13472 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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