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| FOXE3 | Q13461 | AC022655.2-201 | ENST00000577280 | 318 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL591034.3-201 | ENST00000605511 | 685 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | BMPR1B-203 | ENST00000440890 | 5388 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MME-201 | ENST00000360490 | 2360 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ACTR6-212 | ENST00000552376 | 1659 nt | TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KCNJ16-201 | ENST00000283936 | 4062 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PPIP5K2-215 | ENST00000613674 | 4933 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MLH1-212 | ENST00000455445 | 2296 nt | TSL 2 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AGTR2-201 | ENST00000371906 | 2882 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HSP90AA4P-202 | ENST00000506915 | 2228 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MTUS1-228 | ENST00000544260 | 3650 nt | TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | STON1-GTF2A1L-202 | ENST00000394754 | 3824 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MACC1-201 | ENST00000332878 | 2994 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MCF2-210 | ENST00000536274 | 3461 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EVI5-208 | ENST00000540033 | 7436 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DTNA-208 | ENST00000554864 | 1680 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SNORA60-201 | ENST00000362396 | 134 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RNU6-1175P-201 | ENST00000365200 | 107 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNA5SP235-201 | ENST00000365411 | 114 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RNU6-1286P-201 | ENST00000383871 | 107 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SNORD116-18-201 | ENST00000383961 | 92 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |