Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.3 ms