Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SP140Q13342 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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SP140Q13342 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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