Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NR1H3Q13133 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms