Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
MRPL28Q13084 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.73□□□□□ -2.13
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